衰老相关疾病(ARDs)表现出多种表型,但其发病率均随年龄增长而上升,提示其与衰老过程存在机制上的联系。我们研究了衰老相关基因是否与多个 ARD 簇相关的基因存在系统性差异。基于英国生物银行的 57 种 ARDs,网络分析显示,衰老相关基因虽然很少与 ARD 直接相关,但在蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)和 KEGG 网络中,它们与许多 ARDs 的距离显著高于随机水平。与这种网络重叠相一致,衰老相关基因倾向于位于 KEGG 信号级联的中间层,并与疾病相关基因表现出强烈的共表达以及较低的组织特异性,这表明它们在多种组织中发挥调控作用。相比之下,与多个 ARDs 相关的基因富集于免疫疾病,并且在 PPI 网络中与 ARD 相关的邻近基因较少。相应地,与多个 ARDs 相关的基因也倾向于位于 KEGG 通路末端分支,并表现出较高的表达水平。组织特异性以及与其他衰老相关基因的弱共表达是导致衰老相关基因表达差异的主要原因。最后,基于基因-疾病网络拓扑结构的机器学习整合分析,识别出富集于细胞内信号转导和程序性细胞死亡的候选衰老相关基因。
总而言之,这项工作揭示了多重衰老相关基因影响的两种遗传结构:一种是富集于衰老相关基因的跨组织调控机制,另一种是多效性疾病相关基因中存在的组织特异性、免疫驱动机制。
🔗 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42050229/